Description
基因匹配(match) 卡卡昨天晚上做梦梦见他和可可来到了另外一个星球,这个星球上生物的DNA序列由无数种碱基排列而成(地球上只有4种),而更奇怪的是,组成DNA序列的每一种碱基在该序列中正好出现5次!这样如果一个DNA序列有N种不同的碱基构成,那么它的长度一定是5N。 卡卡醒来后向可可叙述了这个奇怪的梦,而可可这些日子正在研究生物信息学中的基因匹配问题,于是他决定为这个奇怪星球上的生物写一个简单的DNA匹配程序。 为了描述基因匹配的原理,我们需要先定义子序列的概念:若从一个DNA序列(字符串)s中任意抽取一些碱基(字符),将它们仍按在s中的顺序排列成一个新串u,则称u是s的一个子序列。对于两个DNA序列s1和s2,如果存在一个序列u同时成为s1和s2的子序列,则称u是s1和s2的公共子序列。 卡卡已知两个DNA序列s1和s2,求s1和s2的最大匹配就是指s1和s2最长公共子序列的长度。 [任务] 编写一个程序:  从输入文件中读入两个等长的DNA序列;  计算它们的最大匹配;  向输出文件打印你得到的结果。
Input
输入文件中第一行有一个整数N,表示这个星球上某种生物使用了N种不同的碱基,以后将它们编号为1…N的整数。 以下还有两行,每行描述一个DNA序列:包含5N个1…N的整数,且每一个整数在对应的序列中正好出现5次。
Output
输出文件中只有一个整数,即两个DNA序列的最大匹配数目。
Sample Input
2

1 1 2 2 1 1 2 1 2 2

1 2 2 2 1 1 2 2 1 1

Sample Output
7

HINT

[数据约束和评分方法]
60%的测试数据中:1<=N <= 1 000
100%的测试数据中:1<=N <= 20 000

解法:就是求LCS,显然普通O(n^2)是会T的,所以我们考虑LCS的一些性质

LCS的决策+1的条件是a[i]==b[j] 于是我们记录a序列中每个数的5个位置

扫一下b[i] 对于每个b[i]找到b[i]在a中的5个位置 这5个位置的每个dp[pos]值都可以被b[i]更新 于是找到f[1]到

dp[pos-1]的最大值+1 更新dp[pos]即可

这个用树状数组维护 时间复杂度O(nlogn)

//BZOJ 1264 LCIS

#include <bits/stdc++.h>
using namespace std;

const int maxn = 20010;
int n, a[maxn*5], b[maxn*5], c[maxn*5], dp[maxn*5], pos[maxn*5][6];

void update(int x, int y){
 for(; x<=n*5; x+=x&-x) c[x] = max(c[x], y);
}

int query(int x){
 int res = 0;
 for(;x;x-=x&-x) res=max(res,c[x]);
 return res;
}

int main()
{
 scanf("%d", &n);
 for(int i=1; i<=n*5; i++){
 scanf("%d", &a[i]);
 pos[a[i]][++pos[a[i]][0]]=i;
 }
 for(int i=1; i<=n*5; i++){
 scanf("%d", &b[i]);
 }
 for(int i=1; i<=n*5; i++){
 for(int j=5;j;j--){
 int k=pos[b[i]][j];
 dp[k] = max(dp[k], query(k-1)+1);
 update(k, dp[k]);
 }
 }
 int ans = query(5*n);
 cout<<ans<<endl;
 return 0;
}