描述
一个 DNA 序列由 A/C/G/T 四个字母的排列组合组成。 G 和 C 的比例(定义为 GC-Ratio )是序列中 G 和 C 两个字母的总的出现次数除以总的字母数目(也就是序列长度)。在基因工程中,这个比例非常重要。因为高的 GC-Ratio 可能是基因的起始点。
给定一个很长的 DNA 序列,以及限定的子串长度 N ,请帮助研究人员在给出的 DNA 序列中从左往右找出 GC-Ratio 最高且长度为 N 的第一个子串。
DNA序列为 ACGT 的子串有: ACG , CG , CGT 等等,但是没有 AGT , CT 等等
数据范围:字符串长度满足 1 \le n \le 1000 \1≤n≤1000 ,输入的字符串只包含 A/C/G/T 字母
输入描述:
输入一个string型基因序列,和int型子串的长度
输出描述:
找出GC比例最高的子串,如果有多个则输出第一个的子串
示例1
输入:
ACGT 2复制
输出:
CG复制
说明:
ACGT长度为2的子串有AC,CG,GT3个,其中AC和GT2个的GC-Ratio都为0.5,CG为1,故输出CG
示例2
输入:
AACTGTGCACGACCTGA 5复制
输出:
GCACG复制
说明:
虽然CGACC的GC-Ratio也是最高,但它是从左往右找到的GC-Ratio最高的第2个子串,所以只能输出GCACG。
解题思路:
本质上是求最值子串的问题,肯定是需要穷举完所有字符的,子串长度固定,每次子串向后移动一位
我们很容易想到利用队列这种数据结构,每次在队尾添加新的元素、同时从队头弹出一个元素。
#include <iostream> #include <vector> #include <queue> using namespace std; int main() { string str; while (cin >> str) { // 注意 while 处理多个 case int n; cin >> n; queue<char>tmp; int res = 0; int one = 0; queue<char> result; for (int i = 0; i < str.size(); i++) { tmp.push(str[i]); if (str[i] == 'C' || str[i] == 'G') one++; if (tmp.size() == n) { if (one > res) { result = tmp; res = one; } if (tmp.front() == 'C' || tmp.front() == 'G') one--; tmp.pop(); } } for (int i = 0; i < n; i++) { cout << result.front(); result.pop(); } cout << endl; } return 0; } // 64 位输出请用 printf("%lld")