$(function() {

    $('#modal-click-error').on('click', function() {
        $('#myModal').modal('show');
        
        $("#myModal .btn-primary").on('click', function() {
            alert("提交");
        });
    });
    
});

这样，每弹出一次就绑定一次。
改为：

$(function() {

    $('#modal-click-error').on('click', function() {
        $('#myModal').modal('show');
    });
    
    $("#myModal .btn-primary").on('click', function() {
        alert("提交");
    });
    
});