逻辑回归需要掌握的知识点

源代码地址:https://github.com/w1449550206/Cancer-prediction-based-on-logistic-regression.git

  • 知道逻辑回归的损失函数
  • 知道逻辑回归的优化方法
  • 知道sigmoid函数
  • 知道逻辑回归的应用场景
  • 应用LogisticRegression实现逻辑回归预测
  • 知道精确率、召回率指标的区别
  • 知道如何解决样本不均衡情况下的评估
  • 了解ROC曲线的意义说明AUC指标大小
  • 应用classification_report实现精确率、召回率计算
  • 应用roc_auc_score实现指标计算

一、分类评估方法

复习:分类评估指标

1. 分类评估方法

1.1 精确率与召回率

1.1.1 混淆矩阵

在分类任务下,预测结果(Predicted Condition)与正确标记(True Condition)之间存在四种不同的组合,构成混淆矩阵(适用于多分类)
(交叉表)
例子:
**真实值------预测结果
A --------------A
A---------------B
B---------------A
B--------------- B
A ---------------A
那么
真正例AA
伪反例AB
伪正例BA
真反例BB

**

1.1.2 精确率(Precision)与召回率(Recall)

  • 精确率:预测结果为正例样本中真实为正例的比例(了解)TP/(TP+FP)

  • 召回率:真实为正例的样本中预测结果为正例的比例(查得全,对正样本的区分能力)TP/(TP+FN)

1.2 F1-score

还有其他的评估标准,F1-score,反映了模型的稳健型
计算出了精确率和召回率并且知道了TP,FN,FP,就可以计算出F–score,体现了精确率和召回率,这个值越大越好


1.3 分类评估报告api

- sklearn.metrics.classification_report(y_true, y_pred, labels=[], target_names=None )

    • y_true:真实目标值
    • y_pred:估计器预测目标值
    • labels:指定类别对应的数字
    • target_names:目标类别名称
    • return:每个类别精确率与召回率
ret = classification_report(y_test, y_predict, labels=(2,4), target_names=("良性", "恶性"))
print(ret)

labels=(2,4)本文中的数据2是良性,4是恶性,通过target_names=(“良性”, “恶性”))给了他们名字。
假设这样一个情况,如果99个样本癌症,1个样本非癌症,不管怎样我全都预测正例(默认癌症为正例),准确率就为99%但是这样效果并不好,这就是样本不均衡下的评估问题

问题:如何衡量样本不均衡下的评估

1.4 分类评估报告api的癌症演示

至此,我们去癌症的案例中去尝试
案例地址:https://github.com/w1449550206/Cancer-prediction-based-on-logistic-regression.git

#获取预测值
y_predict = estimate.predict(x_test)

res = classification_report(y_true=y_test, y_pred=y_predict,labels= [2,4],target_names=['良性','恶性'])

res

type(res)

print(res)
# support指的是样本

2. ROC曲线与AUC指标

2.1 TPR与FPR

一个混淆矩阵只能计算出一个TPR一个FPR

  • TPR = TP / (TP + FN)正例的召回率
    • 所有真实类别为1的样本中,预测类别为1的比例
  • FPR = FP / (FP + TN))假例的召回率
    • 所有真实类别为0的样本中,预测类别为1的比例


      例子:
      五个样本
      计算出概率后
      设置阈值为0.5
      可以获得预测值
      拿预测值和真实值得到一个混淆矩阵
概率 预测值 真实值
0.3 B B
0.4 B B
0.2 B A
0.8 A A
0.7 A B

改变阈值的话,虽然概率不变,但预测值也不一样,阈值从0,0.1,0.2。。。一直变到1
概率是固定的
阈值改变一次
就改变一次混淆矩阵

2.2 ROC曲线

  • ROC曲线的横轴就是FPRate,纵轴就是TPRate,当二者相等时,表示的意义则是:对于不论真实类别是1还是0的样本,分类器预测为1的概率是相等的,此时AUC为0.5

假值的召回率FPR作为横坐标

真值的召回率TPR作为纵坐标

Threshold是阈值的意思

阈值从0变化到1,才会得到不同的TPR金额FPR,才可以有很多的点,去绘制ROC曲线

模型越好,蓝线越弯向于左上角

这样可以看出模型的好坏,对比两个模型的ROC

但是从ROC图形来看模型好不好是我们人工看的,计算机怎么识别呢?这就需要AUC指标了

红色的这根线就是随便猜测的一个模型,最差的得到的就是红色的这个模型

2.3 AUC指标

AUC指标是由ROC曲线中得到来的,就是下面这部分的面积

  • AUC的概率意义是随机取一对正负样本,正样本得分大于负样本的概率
  • AUC的最小值为0.5,最大值为1,取值越高越好 AUC是面积,最大值是1,最小值是0.5,因为最差的就设置到0.5了,就是那条红色的虚线
  • **AUC=1,完美分类器,采用这个预测模型时,不管设定什么阈值都能得出完美预测。绝大多数预测的场合,不存在完美分类器。
  • 0.5<AUC<1,优于随机猜测。这个分类器(模型)妥善设定阈值的话,能有预测价值。

最终AUC的范围在[0.5, 1]之间,并且越接近1越好

2.4 AUC计算API

- from sklearn.metrics import roc_auc_score
- sklearn.metrics.roc_auc_score(y_true, y_score)
- 计算ROC曲线面积,即AUC值
- y_true:每个样本的真实类别,必须为0(反例),1(正例)标记
- y_score:预测得分,可以是正类的估计概率、置信值或者分类器方法的返回值

# 0.5~1之间,越接近于1约好
y_test = np.where(y_test > 2.5, 1, 0)

print("AUC指标:", roc_auc_score(y_test, y_predict)

不会错的计算方法:

import numpy as np
from sklearn import metrics
fpr, tpr, thresholds = metrics.roc_curve(y_c, y_d, pos_label=2)
metrics.auc(fpr, tpr)

2.5 ROC的AUC计算的癌症演示

至此,我们去癌症的案例中去尝试
案例地址:https://github.com/w1449550206/Cancer-prediction-based-on-logistic-regression.git

需要注意的是,roc_auc_score 中如果没有pos_label是不能使用的,具体见另一篇文章https://vicky.blog.csdn.net/article/details/104545096

代码:

y_test

y_predict

y_a = y_test

y_b = y_predict

# # 尝试1 不行
# roc_auc_score(y_true=y_a,y_score=y_b)

# #尝试2 不行
# y_c = np.array(y_a,dtype='float64')

# y_d = np.array(y_b,dtype='float64')

# roc_auc_score(y_true=y_c,y_score=y_d)

# 尝试3 可以
import numpy as np
from sklearn import metrics
fpr, tpr, thresholds = metrics.roc_curve(y_a, y_b, pos_label=2)
metrics.auc(fpr, tpr)

# 尝试4 可以
import numpy as np
from sklearn import metrics
fpr, tpr, thresholds = metrics.roc_curve(y_c, y_d, pos_label=2)
metrics.auc(fpr, tpr)

小技巧:在jupyter notebook中 shift+m 考科一合并cell

二、ROC曲线的绘制

关于ROC曲线的绘制过程,通过以下举例进行说明

假设有6次展示记录,有两次被点击了,得到一个展示序列(1:1,2:0,3:1,4:0,5:0,6:0),前面的表示序号,后面的表示点击(1)或没有点击(0)。

然后在这6次展示的时候都通过model算出了点击的概率序列。

下面看三种情况。

1.曲线绘制

1.1 如果概率的序列是(1:0.9,2:0.7,3:0.8,4:0.6,5:0.5,6:0.4)。

与原来的序列一起,得到序列(从概率从高到低排)

1 1 0 0 0 0
0.9 0.8 0.7 0.6 0.5 0.4

绘制的步骤是:

1)把概率序列从高到低排序,得到顺序(1:0.9,3:0.8,2:0.7,4:0.6,5:0.5,6:0.4);

2)从概率最大开始取一个点作为正类,取到点1,计算得到TPR=0.5,FPR=0.0;

3)从概率最大开始,再取一个点作为正类,取到点3,计算得到TPR=1.0,FPR=0.0;

4)再从最大开始取一个点作为正类,取到点2,计算得到TPR=1.0,FPR=0.25;

5)以此类推,得到6对TPR和FPR。

然后把这6对数据组成6个点(0,0.5),(0,1.0),(0.25,1),(0.5,1),(0.75,1),(1.0,1.0)。

这6个点在二维坐标系中能绘出来。

看看图中,那个就是ROC曲线。

1.2 如果概率的序列是(1:0.9,2:0.8,3:0.7,4:0.6,5:0.5,6:0.4)

与原来的序列一起,得到序列(从概率从高到低排)

1 0 1 0 0 0
0.9 0.8 0.7 0.6 0.5 0.4

绘制的步骤是:

6)把概率序列从高到低排序,得到顺序(1:0.9,2:0.8,3:0.7,4:0.6,5:0.5,6:0.4);

7)从概率最大开始取一个点作为正类,取到点1,计算得到TPR=0.5,FPR=0.0;

8)从概率最大开始,再取一个点作为正类,取到点2,计算得到TPR=0.5,FPR=0.25;

9)再从最大开始取一个点作为正类,取到点3,计算得到TPR=1.0,FPR=0.25;

10)以此类推,得到6对TPR和FPR。

然后把这6对数据组成6个点(0,0.5),(0.25,0.5),(0.25,1),(0.5,1),(0.75,1),(1.0,1.0)。

这6个点在二维坐标系中能绘出来。

看看图中,那个就是ROC曲线。

1.3 如果概率的序列是(1:0.4,2:0.6,3:0.5,4:0.7,5:0.8,6:0.9)

与原来的序列一起,得到序列(从概率从高到低排)

0 0 0 0 1 1
0.9 0.8 0.7 0.6 0.5 0.4

绘制的步骤是:

11)把概率序列从高到低排序,得到顺序(6:0.9,5:0.8,4:0.7,2:0.6,3:0.5,1:0.4);

12)从概率最大开始取一个点作为正类,取到点6,计算得到TPR=0.0,FPR=0.25;

13)从概率最大开始,再取一个点作为正类,取到点5,计算得到TPR=0.0,FPR=0.5;

14)再从最大开始取一个点作为正类,取到点4,计算得到TPR=0.0,FPR=0.75;

15)以此类推,得到6对TPR和FPR。

然后把这6对数据组成6个点(0.25,0.0),(0.5,0.0),(0.75,0.0),(1.0,0.0),(1.0,0.5),(1.0,1.0)。

这6个点在二维坐标系中能绘出来。

看看图中,那个就是ROC曲线。

2.意义解释

如上图的例子,总共6个点,2个正样本,4个负样本,取一个正样本和一个负样本的情况总共有8种。

上面的第一种情况,从上往下取,无论怎么取,正样本的概率总在负样本之上,所以分对的概率为1,AUC=1。再看那个ROC曲线,它的积分是什么?也是1,ROC曲线的积分与AUC相等。

上面第二种情况,如果取到了样本2和3,那就分错了,其他情况都分对了;所以分对的概率是0.875,AUC=0.875。再看那个ROC曲线,它的积分也是0.875,ROC曲线的积分与AUC相等。

上面的第三种情况,无论怎么取,都是分错的,所以分对的概率是0,AUC=0.0。再看ROC曲线,它的积分也是0.0,ROC曲线的积分与AUC相等。

很牛吧,其实AUC的意思是——Area Under roc Curve,就是ROC曲线的积分,也是ROC曲线下面的面积。

绘制ROC曲线的意义很明显,不断地把可能分错的情况扣除掉,从概率最高往下取的点,每有一个是负样本,就会导致分错排在它下面的所有正样本,所以要把它下面的正样本数扣除掉(1-TPR,剩下的正样本的比例)。总的ROC曲线绘制出来了,AUC就定了,分对的概率也能求出来了。