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生物信息学 ...

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全部文章 / 生物信息学王建新谢民主（共5篇）

Minimap2

Minimap2是知名比对工具BWA的开发者Li Heng新开发的比对工具，它能够快速的将DNA或者mRNA序列比对到参考基因组上，使用场景有下面几种：将PacBio或OXford Nanopore的read和已有参考基因组（如人类）进行比对寻找高错误率read(15%)之间的overlap ...

2022-05-21

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PAF（Pairwise mApping Format）

PAF PAF（Pairwise mApping Format）是一种用于存储序列比对结果的文件格式，文本文件，每一行代表一条记录。一行必需12个字段，由\t分割，分别为： Query sequence name； Query sequence length； Query Start，匹配上que...

2022-05-21

0 2122

refseqID转换为geneID

refseqID转换为geneID（2018-06-05）简单点lili已关注 0.2492018.06.05 13:39:02字数 191阅读 3,260 1 refseqID转换成geneID 下载gen...

2022-05-12

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理解如何利用偏序比对法进行多序列比对

本文翻译自 Understanding Partial Order Alignment for Multiple Sequence Alignment，原文链接在 http://simpsonlab.github.io/2015/05/01/understandi...

2022-05-04

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理解如何利用偏序比对法进行多序列比对

本文翻译自 Understanding Partial Order Alignment for Multiple Sequence Alignment，原文链接在 http://simpsonlab.github.io/2015/05/01/understandi...

2022-05-04

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